FEV_KEGG.Experiments.13 module¶
Question¶
Which EC numbers are present in all Escherichia coli K-12 organisms?
Method¶
- Get all metabolic pathways of all E. coli organisms from KEGG.
- For each organisms, combine all pathways to the metabolic network, by UNION operation.
- Convert this metabolic network into a substance-ecNumber graph.
- Combine all organisms’ networks to a consensus network, by INTERSECT operation, leaving only substances and EC numbers that occur in all organisms.
- Print all EC numbers that occur in all organisms.
Result¶
560 results
1.-.-.-
1.1.-.-
1.1.1.-
1.1.1.1
1.1.1.100
1.1.1.103
1.1.1.127
1.1.1.130
1.1.1.140
1.1.1.169
1.1.1.17
1.1.1.205
1.1.1.22
1.1.1.23
1.1.1.25
1.1.1.262
1.1.1.267
1.1.1.282
1.1.1.290
1.1.1.336
1.1.1.350
1.1.1.37
1.1.1.38
1.1.1.380
1.1.1.40
1.1.1.42
1.1.1.6
1.1.1.60
1.1.1.77
1.1.1.86
1.1.1.94
1.1.2.3
1.1.5.12
1.1.5.2
1.1.5.3
1.1.5.4
1.1.98.6
1.1.99.1
1.11.1.21
1.11.1.6
1.11.1.9
1.12.99.6
1.13.11.16
1.14.12.19
1.14.13.127
1.14.14.5
1.14.99.46
1.17.1.4
1.17.1.8
1.17.4.1
1.17.7.4
1.18.1.3
1.2.1.-
1.2.1.11
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1.2.1.70
1.2.1.71
1.2.1.72
1.2.1.8
1.2.1.99
1.2.4.1
1.2.4.2
1.2.5.1
1.3.1.-
1.3.1.1
1.3.1.28
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1.3.5.3
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1.4.1.4
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1.4.3.16
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1.5.1.-
1.5.1.2
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1.6.1.1
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1.6.5.2
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1.7.99.-
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2.3.1.-
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2.4.2.-
2.4.2.1
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2.5.1.-
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2.7.1.-
2.7.1.107
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2.7.8.-
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3.4.13.-
3.5.1.-
3.5.1.1
3.5.1.10
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3.5.99.6
3.6.1.-
3.6.1.13
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3.7.1.14
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4.1.2.4
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4.1.3.-
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4.3.1.17
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5.3.1.-
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5.3.1.8
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5.4.2.12
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5.4.3.8
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5.4.99.18
6.1.1.1
6.1.1.10
6.1.1.11
6.1.1.12
6.1.1.14
6.1.1.15
6.1.1.16
6.1.1.17
6.1.1.18
6.1.1.19
6.1.1.2
6.1.1.20
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6.1.1.22
6.1.1.3
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6.1.1.5
6.1.1.6
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6.1.1.9
6.2.1.1
6.2.1.26
6.2.1.3
6.2.1.5
6.3.1.1
6.3.1.11
6.3.1.2
6.3.1.20
6.3.1.5
6.3.2.1
6.3.2.10
6.3.2.13
6.3.2.14
6.3.2.2
6.3.2.3
6.3.2.4
6.3.2.6
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6.3.2.9
6.3.3.1
6.3.3.2
6.3.3.3
6.3.4.13
6.3.4.15
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6.3.4.2
6.3.4.20
6.3.4.21
6.3.4.4
6.3.4.5
6.3.5.2
6.3.5.3
6.3.5.4
6.3.5.5
6.4.1.2
Conclusion¶
Alls organisms of E. coli K-12 share a high number of EC numbers.